교토대학의 생명과학연구과 후시 나오유키 연구원, 이학연구과 아형 청화교수 등의 연구그룹은 암흑파리의 게놈 해석을 실시하여 환경적응에 관련된 게놈 배열을 좁히는 데 성공했습니다.환경 적응의 메카니즘에 육박하는 것으로 하고 있습니다.국립유전학연구소와의 공동연구에 의한 성과입니다.
교토대학에서는 1954년부터 61년간 초파리를 1500세대에 걸쳐 어둠 속에서 계대사육하고 있으며, 「암흑파리」라고 불리고 있습니다.외관은 보통의 야생형 파리와 다르지 않지만, 어둠 속에서 야생형 파리보다 우위에 자손을 남기기 때문에, 어둠에 적응하고 있다고 되었습니다.게놈의 염기 서열 중 1염기가 다른 현상을 1염기 다형(SNP)이라고 하며, 다양성을 낳는 요인으로 되어 있습니다만, 이전의 연구에서, 암흑 파리의 전체 게놈 서열을 결정해, 약 22 만의 SNP를 확인했습니다.그러나 어떤 SNP가 어둠 적응에 관여하는지 알 수 없었다.
이번에, 암흑 파리와 야생형 파리의 혼합 집단을 명소와 암소에서 계대했습니다.계대를 반복하면 양자의 게놈이 혼합되어 어둠 적응에 관련된 SNP가 암소 집단에서 빈도가 상승할 것으로 예상되었다.게놈 분석을 통해 암흑 파리 SNP의 빈도 변화를 조사하면 약 6%의 게놈 서열이 어두운 곳에서 선택되었으며, 암흑 적응에 관련된 후보 유전자로서 84 유전자가 동정되었다.여기에는 후각과 일상 리듬에 관련된 유전자가 포함되어있었습니다.
「암흑파리」의 환경적응에 관련된 후보유전자를 리스트업한 성과에 가세해 혼합집단을 다른 환경에서 계대함으로써 환경적응에 관여하는 게놈 서열을 좁히는 실험예를 나타내고, 환경적응의 연구에 새로운 방법론을 제안했습니다.앞으로, 암흑파리의 유전자 발현의 해석 결과와 게놈 해석의 결과를 통합하여 적응 유전자를 동정하고, 또, 암흑파리의 SNP를 야생형 파리의 게놈에 도입함으로써 암흑파리 SNP의 영향을 검증하고 싶다 라는 것입니다.
