오사카대학 단백질연구소의 쿠리스 겐지 교수가 대표를 맡는 일본 단백질 구조 데이터 뱅크(PDBj)는 아시아의 대표 기관으로서 신형 코로나 바이러스(SARS-CoV-2)의 새롭게 분석된 단백질 구조 정보를 단백질 구조 데이터베이스에 등록했다.또 2020년 3월 11일부터 PDBj 홈페이지에 신형 코로나 바이러스 특집 페이지를 개설하여 일반 공개를 시작했다.신형 코로나바이러스에 직접 관련된 엔트리만을 엄밀하게 추출하여 데이터를 제공하고, 매주 수요일, 일본 시간의 오전 9시에 최신 엔트리를 추가 갱신한다.정보는 일영중한의 각 언어로 제공한다.
단백질 구조 데이터베이스는 세계에서 유일하게 실험적으로 결정된 생체 고분자의 3 차원 구조를 저장하는 데이터베이스.매일 전세계 200만 건 이상이 다운로드되어 폭넓은 연구에 활용되고 있으며, 항인플루엔자 약 자나미비르(상품명 리렌자)와 오셀타미비르(상품명 타미플루)의 개발에도 이어지고 있다.
단백질 구조 데이터베이스는 PDBj를 포함한 일미 유럽의 세계 4 거점이 공동으로 등록·유지·관리를 하고 있으며, 전세계 연구자들은 구조 해석한 단백질의 구조 정보는 반드시 사전에 등록하게 되어 있다.통상, 등록이 끝난 PDB 데이터는 해당의 정보를 포함한 연구가 논문으로서 발표될 때까지 비공개로 되지만, 이번, 신형 코로나 바이러스의 구조 정보가 데이타베이스에 등록되었을 경우, 개별적으로 등록자(연구자 )와 연락을 취하고, 논문 발표를 기다리지 않고 즉시 공개하는 것을 강하게 장려하게 되었다.
이번 대응에 대해 쿠리스 교수는 “국제적인 데이터베이스 구축 거점이 국내에 있어 국제적으로 널리 신뢰되는 이점을 최대한 살려 정확하고 사용하기 쉬운 데이터를 일본어(중국어, 한국어 )로 신속하게 제공합니다.평시에는, 수도나 도시 가스와 같이 사용할 수 있어 당연하다고 생각되고 있는 정보 기반은, 긴급 사태가 될수록 스피드감을 가지고, 평소 이상의 정밀도로 제공하는 것이 중요하다는 것을 아파요.”라고 덧붙였다.
